Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtpaQ8BWP5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms