Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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