Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms