Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Snx17Q8BVL3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx17Q8BVL3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx17Q8BVL3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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