Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pdcl3Q8BVF2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms