Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms