Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms