Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms