Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube3cQ80U95 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms