Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec18aQ7TSQ1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec18aQ7TSQ1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec18aQ7TSQ1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec18aQ7TSQ1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec18aQ7TSQ1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clec18aQ7TSQ1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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