Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PhkbQ7TSH2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms