Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms