Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms