Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms