Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Vma21Q78T54 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Vma21Q78T54 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Vma21Q78T54 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Vma21Q78T54 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Vma21Q78T54 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Vma21Q78T54 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Vma21Q78T54 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Vma21Q78T54 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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