Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms