Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmeff1Q6PFE7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms