Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup98Q6PFD9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup98Q6PFD9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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