Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Zbtb40Q6PCS8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms