Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smchd1Q6P5D8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smchd1Q6P5D8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smchd1Q6P5D8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smchd1Q6P5D8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smchd1Q6P5D8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smchd1Q6P5D8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Smchd1Q6P5D8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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