Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrimpolQ6P1E7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrimpolQ6P1E7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms