Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tpm4Q6IRU2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tpm4Q6IRU2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tpm4Q6IRU2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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