Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarca2Q6DIC0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms