Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbf1Q6DFZ1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbf1Q6DFZ1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gbf1Q6DFZ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gbf1Q6DFZ1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gbf1Q6DFZ1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gbf1Q6DFZ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gbf1Q6DFZ1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gbf1Q6DFZ1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gbf1Q6DFZ1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms