Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms