Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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