Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms