Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms