Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms