Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme4Q5SSW2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme4Q5SSW2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms