Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Khdc1cQ4KL78 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms