Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms