Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm28047Q3US59 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm28047Q3US59 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm28047Q3US59 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm28047Q3US59 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28047Q3US59 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm28047Q3US59 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm28047Q3US59 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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