Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsponQ3UPR9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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