Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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