Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim43aQ3TL54 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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