Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp444Q3TDV8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms