Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RubcnlQ3TD16 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RubcnlQ3TD16 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RubcnlQ3TD16 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RubcnlQ3TD16 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RubcnlQ3TD16 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RubcnlQ3TD16 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RubcnlQ3TD16 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RubcnlQ3TD16 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RubcnlQ3TD16 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms