Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem248Q3TBN1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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