Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms