Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms