Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms