Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms