Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sox8Q04886 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms