Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms