Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms