Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms