Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snai1Q02085 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms