Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col1a2Q01149 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms