Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms